熒光定量PCR分析儀通過實時監測熒光信號變化，結合Ct值與標準曲線分析，實現基因的精準定量，其核心原理與實現步驟如下：

　　核心原理

　　在PCR擴增反應體系中加入熒光基團（如SYBRGreen染料或TaqMan探針），使熒光信號強度與擴增產物量同步變化。每完成一個PCR循環，儀器采集一次熒光信號，生成擴增曲線。通過設定熒光閾值（通常為基線信號的10倍標準差），確定擴增產物達到閾值時的循環數（Ct值）。Ct值與起始模板量呈負相關，即起始模板量越多，Ct值越小。

　　實現步驟

　　標準曲線構建：使用已知濃度的標準品（如純化質粒DNA或體外轉錄RNA）進行梯度稀釋，以不同濃度的標準品為模板進行PCR擴增。以標準品拷貝數的對數為橫坐標，Ct值為縱坐標繪制標準曲線。當標準品濃度范圍在10²-10¹?拷貝數時，模板濃度與Ct值通常呈現良好的線性關系（相關系數R²>0.99），確保在此范圍內可準確定量。

　　未知樣本檢測：將未知樣本與標準品同步擴增，根據其Ct值代入標準曲線公式，計算樣本中目標基因的拷貝數。例如，若標準曲線公式為y=3.1372x+38.201（y為Ct值，x為拷貝數對數），通過反向計算即可得出樣本的初始模板量。

　　內參基因校正（相對定量）：在需要比較不同樣本間基因表達差異時，選擇管家基因（如GAPDH、β-actin）作為內參，通過計算目標基因與內參基因的Ct值差值（ΔCt），進一步采用ΔΔCt法分析相對表達量，消除樣本量及反應效率差異的影響。